1.06 ma błędy, które w Atari poprawiono i puszczono jako TOS 1.62. I ten warto mieć, kompatybilność 100% z softem STE. Można też 2.06 zainstalować (dla Mega STE), bo użytkowo wygodniejszy, ale nieco zmniejszysz kompatybilność z grami i demami STE. Więc najlepiej mieć przełącznik TOS-ów i mieć ich kilka pod reką, te dwa (1.62 i 2.06) minimalnie. Takie rozwiązania są dostępne (u nas: kkrys, MatGuru).